В последнее время усадьба, видимо, не охраняется, потому что в нее проникли молодые люди, местные любители экстремальных видов спорта, и сняли ролик о своей прогулке внутри дома. Об этом Евгения Комарова, председатель Общественной палаты, рассказала своим коллегам на очередном заседании Общественной палаты, составлявшемся 17 февраля. Ролик «спортсменов» можно найти на Youtube и во Вконтакте. По словам Евгении Комаровой, проникновение в усадьбу — это плохой признак. Если так дальше пойдет, то к лету от нее мало что останется.
За усадьбой Пущино-на-Оке постоянно следила семья Голубевых, проживавшая поблизости. В связи со смертью главной хранительницы Клавдии Егоровны Голубевой усадьба с осени осталась без присмотра. Чтобы спасти памятник, Евгения Комарова намерена обратиться в МЧС с просьбой заколотить окна и проходы в здание.
С 1985 года усадьба Пущино-на-Оке и парковый ансамбль охраняются государством, это объект исторического и культурного наследия федерального значения, но денег на ее реконструкцию и охрану не выделяют. Земля под усадьбой находится в федеральной собственности, а постройками управляла Академия науки, теперь они в ведении ФАНО. В целом же памятником распоряжается Госкомимущество. Из-за сложных межведомственных взаимодействий усадьба стоит покинутая, постепенно разрушаясь от времени.